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大腸桿菌感受態(tài)也有“身份正”?

2021-5-10  閱讀(2173)

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什么是感受態(tài)?

感受態(tài)細胞(competent cell):是指受體(宿主)細胞最易接受外源DNA片段并實現(xiàn)其轉(zhuǎn)化的一種生理狀態(tài)。主要原理是通過處理使細胞的通透性變大(細胞膜表面出現(xiàn)一些孔洞),便于外源基因或載體進入感受態(tài)細胞,在感受態(tài)細胞中得到復(fù)制擴增,得到多個拷貝的外源基因或載體。

 

感受態(tài)的分類

 

 
 

根據(jù)不同實驗?zāi)康?,感受態(tài)細胞來源有原核受體細胞(大腸桿菌G-、乳酸菌G+、枯草桿菌G+ 和真核受體細胞(酵母菌、動植物、昆蟲等)。大腸桿菌作為構(gòu)建普通質(zhì)粒、病毒載體和各種文庫以及異源蛋白表達的重要工具,其相應(yīng)的感受態(tài)在分子克隆實驗與蛋白表達實驗中是極其重要的。

 

 

不同感受態(tài)的區(qū)別是什么呢?

目前市面上的大腸桿菌細胞種類相當多,其都是為了特定的目的而構(gòu)建的,比如:高速生長/分裂,高通量克隆,普通克隆等。那不同的感受態(tài)之間的區(qū)別是什么呢?答案是基因型(即感受態(tài)的身份正),不同基因型的大腸桿菌可以滿足不同的實驗?zāi)康摹?/font>

 

感受態(tài)說明書的基因型部分寫的recA,deoRlacZ,DE3pLysS都代表什么意義呢?今天小翌根據(jù)幾個方向的實驗?zāi)康慕o大家介紹一些常見的基因型以及意義。

 

1、提高外源質(zhì)粒的完整性和穩(wěn)定性

基因型

意義

recA

recA基因表達ATP依賴型DNA重組酶,其缺陷型可以降低DNA重組(recombination)的概率。

dam/dcm

消除宿主對腺嘌呤(Adenine)和胞嘧啶(Cytosine)的甲基化。幫助某些外源質(zhì)粒復(fù)制,易于得到非甲基化的質(zhì)粒。

endA

對非特異性限制酶(Non-specific Endonuclease I)進行基因敲除(Knock-out),以減少限制酶的活性,進而降低對外源DNA的剪切,提高外源質(zhì)粒的數(shù)量和質(zhì)量。

mcrA/mcrBC

/mrr

大腸桿菌防御系統(tǒng)中最要的組成部分,可以識別外源序列,基因突變后,宿主對部分外源質(zhì)粒的防御缺失,可以用于基因組DNA或者甲基化cDNA的克隆。

hsdR/hsdS

連個基因分別編碼型限制酶EcoKEcoB 的R亞基(限制酶)、M亞基(甲基化酶)。

HsdR基因的變異導(dǎo)致菌株細胞內(nèi)的EcoKEcoB活性缺失,hsdS基因的變異使hsdRhsdM不能正確識別其作用的特異DNA序列,可以保證外源DNA的穩(wěn)定性。

 

2、提高轉(zhuǎn)化效率

基因型

意義

deoR

去除某些調(diào)控基因,使得用于脫氧核糖生成的基因得到大量表達。使得超長質(zhì)粒得以完整復(fù)制,提高轉(zhuǎn)化效率。

hee

在電穿孔的過程中,改造過的細胞表現(xiàn)出更強的存活率。

 

3、代謝相關(guān)基因型

基因型

意義

lacZ

lacZ基因是大腸桿菌中lac操縱子的結(jié)構(gòu)基因,表達β-半乳糖苷酶,分解乳糖為半乳糖苷。lacZ基因的變異或缺失將直接導(dǎo)致β-半乳糖苷酶活性缺失,細胞在只有乳糖作為碳源的培養(yǎng)基中不能生長,由此可以進行菌株的篩選和純化。

lacZM15

lacZM15是β-半乳糖苷酶α中的一段,當M15缺失(△M15)時lacZ不能表達β-半乳糖苷酶沒有活性。當帶有lacZα片段)基因的lac操縱子通過載體(如pUC57)轉(zhuǎn)化到 lacZM15基因型的細胞時在有IPTG存在的情況下,β-半乳糖苷酶表現(xiàn)出活性,它能分解X-gal,使其呈現(xiàn)藍色。因此可以通過平板上的藍白菌落進行克隆體的鑒定。

gal

大腸桿菌K12株中通常出現(xiàn)的基因型是galKgalT,由于這兩種基因的變異使細胞不能直接利用半乳糖作為碳源。因此通過在最小培養(yǎng)基中添加半乳糖與否,進行菌株篩選和基因型確認。

ara

ara基因表達阿拉伯糖代謝所需的各種酶,ara基因的變異,使細胞不能利用阿拉伯糖進行能量代謝,可以利用此特性進行菌株篩選。

xyl

xyl基因包含xylAxylB、xylR三種基因。xyl基因的變異使細胞不能以木糖作為碳源進行能量代謝。

 

4、不同的蛋白表達機制

基因型

意義

DE3

T7 RNA聚合酶的基因被重組到大腸桿菌細胞的基因組里,用于T7 promoter調(diào)控的蛋白表達。

pLysS

攜帶T7 lysozyme(溶菌酶),用于摧毀T7 RNA polymerase。調(diào)控T7 promoter蛋白表達系統(tǒng)。

lon

lon基因表達ATP依賴型蛋白酶,它對外源蛋白質(zhì)具有特異性的分解作用。lon基因的變異或缺失,對保持重組蛋白的穩(wěn)定是非常有利的。

lacIq

變異的LacI基因,導(dǎo)致lac repressor的大量表達,因此更嚴格地調(diào)控lac promoter。

ompT

ompT基因表達特異性的外膜蛋白酶,它特異性地分解與細胞膜結(jié)合的含鐵腸菌素受體蛋白。ompT基因的變異使膜結(jié)合性蛋白分解酶活性缺失,有利于融合蛋白的表達。

gor

表達谷胱甘肽還原酶,其基因突變或缺失可以提高形成二硫鍵的能力,有利于富含二硫鍵的蛋白表達。

 

以上是眾多細胞基因型中的一小部分,還有很多不常見的變異菌株,可適用于更加特殊的實驗?zāi)康?,小翌就不過多介紹了。

對于感受態(tài)的選擇,小翌給大家介紹下幾種常見的大腸桿菌感受態(tài)及其應(yīng)用方向。

菌株

特點

用途

DH5α

一種常用于質(zhì)??寺〉木?。缺失核酸內(nèi)切酶 (endA),提高了質(zhì)粒DNA的產(chǎn)量和質(zhì)量;重組酶缺陷型(recA)減少插入片段的同源重組概率,保證了插入DNA 的穩(wěn)定性;lacZΔM15的存在使 DH5α可用于藍、白斑篩選。

構(gòu)建克隆,

質(zhì)粒提取,

藍白斑篩選

TOP

TOP生長速度快 (DH5α),10小時可見克隆,recA1endA1的突變有利于插入DNA的穩(wěn)定和高純度質(zhì)粒DNA的提取。

構(gòu)建克隆,

質(zhì)粒提取,

藍白斑篩選。

BL21DE3

用于T7 RNA 聚合酶為表達系統(tǒng)的高效蛋白表達宿主。可同時表達T7 RNA 聚合酶和大腸桿菌 RNA 聚合酶,用于 pET 系列,pGEX,pMAL 等質(zhì)粒的蛋白表達。

非毒性蛋白的表達。

 

訂購信息

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號

產(chǎn)品規(guī)格

TOPChemically Competent Cell Top化學(xué)感受態(tài)細胞

11801ES80

10×100 μl

DH5α Chemically Competent Cell DH5α化學(xué)感受態(tài)細胞

11802ES80

10×100 μl

BL21 (DE3) Chemically Competent Cell  BL21 (DE3)化學(xué)感受態(tài)細胞

11804ES80

10×100 μl

 

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